Trên mái nhà rộng lớn, ánh nắng mặt trời chiếu rọi xuống những bức tường cổ kính, tạo nên bóng đổ dài trên sàn nhà. Tōma Kamijō đứng đó, ánh mắt nhìn lên bầu trời trong xanh. Anh nhớ lại ngày hôm đó, người con gái đưa cho anh một tình cảm mãnh liệt, nhưng cũng đầy bí ẩn.
Không chút do dự, Tōma nhanh chóng bước vào bên trong ngôi nhà. Cánh cửa toang, tiếng đàn piano ngân nga lên, điểm nhấn trong bức tranh hoang sơ của căn phòng. Anh nhận ra điệu nhạc quen thuộc, nhưng không giờ hợp với không gian lạ lẫm này.
"Bạn đâu rồi?" Tōma gọi. "Tôi đến để giúp bạn."
Một cô gái tuyệt đẹp bước ra từ bóng tối, bước nhẹ nhàng như gió. Ánh sáng vô hình chợt hiện hình, phơi bày dáng vẻ lạ lùng của cô. "Chỉ có bạn mới có thể giúp được tôi," cô nói, giọng điệu nhè nhẹ, đầy ẩn ý.
Tōma cảm thấy mình bị cuốn theo bởi vẻ đẹp bí ẩn của người con gái. Đột nhiên, cô đưa tay ra và một vũ khí ma thuật nhấp nháy trong bàn tay cô. "Hãy giúp tôi, Tōma Kamijō, giải tỏa lời nguyền của Chỉ Mục Cấm Thư," cô van xin, ánh mắt đầy sự mong đợi.
Trong giây phút ấy, Tōma cảm nhận trọng trách nặng nề đặt trên vai mình. Một trận chiến mới sắp bắt đầu, và khám phá về thế giới ma thuật Index đầy bí ẩn, hiểm nguy chờ đợi phía trước.