Truyện tranh "Charlotte" xoay quanh câu chuyện về Khánh - một chàng trai trẻ với khả năng siêu nhiên đặc biệt: có thể làm cho mọi người quanh anh quên hết mọi sự kiện xảy ra trong khoảng thời gian anh muốn. Được nuôi dưỡng và đào tạo từ nhỏ bởi một tổ chức bí ẩn, Khánh đã sử dụng khả năng này để thực hiện những nhiệm vụ nguy hiểm và phức tạp.
Một ngày nọ, Khánh được giao nhiệm vụ tiếp cận và loại bỏ một học sinh cấp ba bí ẩn có tên Thảo - cô gái mang trong mình một sức mạnh cực kỳ nguy hiểm. Tuy nhiên, khi đến gần Thảo, Khánh bất ngờ phát hiện ra rằng cô ấy không chỉ là một cô học sinh bình thường mà còn là người duy nhất có thể khắc phục được nhược điểm của anh - khả năng làm mất trí nhớ.
Dần dần, trái tim lạnh lùng của Khánh tan chảy trước sự trong sáng và tinh nghịch của Thảo. Hai con người đối lập nhưng lại hấp dẫn nhau, họ dần khám phá ra rằng bản chất của sức mạnh không chỉ là để sử dụng mà còn là để bảo vệ và yêu thương. Tình yêu, tình bạn và trách nhiệm cuối cùng sẽ dắt họ đến đâu trong cuộc hành trình đầy biến động này?
