Trong một ngày tuần, Tokio và Azuma đối diện với băng nhóm tội phạm nguy hiểm nhất từ trước đến nay. Với sức mạnh phi thường của họ, Tokio và Azuma không ngần ngại chiến đấu, nhưng số lượng tội phạm quá đông đảo và họ nhanh chóng bị áp đảo. Trước tình thế hiểm nghèo, Azuma rút ra một ống tiêm kỳ lạ từ túi áo và nhấn chìm nó vào cánh tay của Tokio.
Một trận gió lạ kèm theo ánh sáng màu xanh lạ mắt bao phủ toàn bộ không gian. Tokio cảm thấy cơ thể đang trải qua sự biến đổi kỳ lạ, từng tia năng lượng chảy qua mạch máu như muốn cải tạo mọi phần tử trong cơ thể anh. Cảm giác mạnh mẽ không thể tả được tràn ngập cảm giác của Tokio, khiến anh nhận ra rằng anh không còn là bản thân mình nữa.
Khi ánh sáng dần phai nhạt, Tokio mở mắt ra và cảm nhận được một sức mạnh vô song chảy qua từng tấc của cơ thể. Anh không chỉ cảm nhận được sức mạnh vật lý mà còn có khả năng kiểm soát năng lượng xung quanh, biến từng chút sức sống xung quanh thành vũ khí mạnh mẽ để chống lại bọn tội phạm.
Từ đó, Tokio không chỉ là một học sinh trung học bình thường nữa. Anh trở thành Siêu Nhân X, người sở hữu sức mạnh vô song và sẵn sàng chiến đấu vì công lý, nhưng cũng phải đối diện với khủng hoảng tinh thần của việc trở nên mạnh mẽ như vậy. Với lời hứa cùng Azuma, Tokio quyết định sử dụng sức mạnh mới của mình để bảo vệ thành phố khỏi mọi hiểm nguy. Đây chính là sứ mệnh của Siêu Nhân X.